Cygwin を使うと、管理者は、どの Windows PC へも簡単にリモートログインし、 UNIX/Linux のシェルの中で問題を修正し、シェルコマンドスクリプトを実行することができます。標準的なシェルと共に sed や awk などといったツールを併せて使うことで、洗練されたシェルコマンドスクリプトを作成できます。標準の Windows コマンドラインツールaを UNIX/Linux シェル環境の中で使い、 Windows システムを管理することも可能です。長い年月を重ねて UNIX/Linux システム管理者は UNIX/Linux マシンを管理するスクリプトの大きなツールセットを築き上げてきました。 Cygwin はこれらスクリプトを Windows マシン上で使い続けることを可能にします。

開発者が今日直面している最も大きな問題の一つとして、アプリケーションが全く異なるプラットフォームをサポートしなければならないということがあげられます。 Windows ワークステーションは引き続き広まりつつありますが、 Cygwin を使うことで混合環境を一貫した効率的な方法で管理することができます。 Cygwin は UNIX / Linux シェル環境だけでなく多くの非常に便利なコマンド群を Windows プラットフォームに提供できますので、 IT 管理者は効率的によく訓練されたスタッフを配置し、既存の UNIX/Linux のソースコードとシェルスクリプトを活用することができます。

レッドハットは Cygwin について次のようなサービスを提供しています:

• GPL に束縛されることなくお客様のアプリケーションを配布可能に。 つまり、お客様のアプリケーションをオープンソースにする必要をなくせます。
• お客様のアプリケーションに Cygwin を同梱して無制限で配布できるライセンス
• UNIX/Linux から Windows へ簡単に移植できる堅牢なツール群
• 最新の Pentium に最適化されたコンパイラツール